Для установки нажмите кнопочку Установить расширение. И это всё.

Исходный код расширения WIKI 2 регулярно проверяется специалистами Mozilla Foundation, Google и Apple. Вы также можете это сделать в любой момент.

Как перевоплотить Википедию

Хотите, чтобы Википедия всегда выглядела так профессионально и современно? Мы создали расширение для браузера. Оно совершенствует любую страницу энциклопедии, которую вы посетите, с помощью магических технологий WIKI 2.

Попробуйте — вы его можете удалить в любой момент.

Установить за 5 сек.
4,5
Келли Слэйтон
Мои поздравления с отличным проектом... что за великолепная идея!
Александр Григорьевский
Я использую WIKI 2 каждый день
и почти забыл как выглядит оригинальная Википедия.
Статистика
На русском, статей
Улучшено за 24 ч.
Добавлено за 24 ч.
Альтернативы
Недавние
Show all languages
Что мы делаем. Каждая страница проходит через несколько сотен совершенствующих техник. Совершенно та же Википедия. Только лучше.
Great Wikipedia has got greater.
.
Лео
Ньютон
Яркие
Мягкие

Ku80

Из Википедии — свободной энциклопедии

X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
PDB rendering based on 1jeq.PDB rendering based on 1jeq.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1JEQ, 1JEY, 1Q2Z, 1RW2, 3RZ9

Идентификаторы
Символ XRCC5 ; KARP-1; KARP1; KU80; KUB2; Ku86; NFIV
Внешние ID OMIM: 194364  MGI: 104517  HomoloGene: 40681  GeneCards: Ген XRCC5
номер EC 3.6.1. EC 3.6.1.
Генная онтология
Функция • DNA binding

• damaged DNA binding
• double-stranded DNA binding
• double-stranded telomeric DNA binding
• ATP-dependent DNA helicase activity
• protein binding
• ATP binding
• protein C-terminus binding
• ubiquitin protein ligase binding
• telomeric DNA binding
• transcription regulatory region DNA binding
• poly(A) RNA binding

• 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
Компонент клетки • nuclear telomere cap complex

• nuclear chromosome, telomeric region
• nucleus
• nucleoplasm
• nucleolus
• cytosol
• plasma membrane
• membrane
• Ku70:Ku80 complex

• nonhomologous end joining complex
Биологический процесс • telomere maintenance

• DNA repair
• double-strand break repair
• double-strand break repair via nonhomologous end joining
• DNA recombination
• transcription, DNA-templated
• cell proliferation
• viral process
• positive regulation of type I interferon production
• DNA duplex unwinding
• innate immune response
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• regulation of smooth muscle cell proliferation
• positive regulation of neurogenesis
• hematopoietic stem cell differentiation

• establishment of integrated proviral latency
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 7520 22596
Ensembl ENSG00000079246 ENSMUSG00000026187
UniProt P13010 P27641
RefSeq (мРНК) NM_021141 NM_009533
RefSeq (белок) NP_066964 NP_033559
Локус (UCSC) Chr 2:
216.11 – 216.21 Mb		 Chr 1:
72.31 – 72.39 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Ku80 — белок, закодированный у человека геном XRCC5.[1] Вместе с белком Ku70 белок Ku80 образует гетеродимер, связывающийся с концами двунитевых разрывов в ДНК, и требуется для репарации ДНК путём негомологичного соединения концов (NHEJ). Также белок Ku требуется для V(D)J рекомбинации, которая использует путь NHEJ для создания разнообразия антиген-связывающих центров антител в иммунной системе млекопитающих.

Также Ku требуется для поддержания длины теломер и сайленсинга прителомерных генов.[2]

Ku был впервые обнаружен у пациентов с системной красной волчанкой, у которых были выявлены высокие титры антител против этого белка.[1]

Ku80 имеет несколько других названий:

  • Ku аутоантиген, белок p80 волчанки
  • субъединица 2 АТР-зависимой ДНК-хеликазы 2
  • XRCC5 (англ. X-ray repair cross-complementing 5)

Клиническое значение

Редкий микросателлитный полиморфизм данного гена связан с опухолями у пациентов с различной чувствительностью к радиоактивности.[3]

Взаимодействия

Показаны белок-белковые взаимодействия Ku80 с NCOA6,[4][5] GCN5L2,[6] Ku70,[6][7][8][9][10] АТР-зависимой хеликазой синдрома Вернера,[11][12] Тирозин-киназой 2,[13] белком c-Abl в гомологичном киназе каталитическом участке ДНК-зависимой протеинкиназы,[14][15][7] TERF2IP,[16] обратной транскриптазой теломер,[17] POU2F1[18][15] и белком PCNA.[15][19][20]

Примечания

  1. ↑ 1 2 Entrez Gene: XRCC6 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 (Ku autoantigen, 70kDa).
  2. ↑ Boulton S.J., Jackson S.P. Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing (англ.) // EMBO J.  (англ.) (рус. : journal. — 1998. — March (vol. 17, no. 6). — P. 1819—1828. — doi:10.1093/emboj/17.6.1819. — PMID 9501103. — PMC 1170529.
  3. ↑ Entrez Gene: XRCC5 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining; Ku autoantigen, 80kDa). Архивировано 8 марта 2010 года.
  4. ↑ Ko, L; Cardona G R., Chin W W. Thyroid hormone receptor-binding protein, an LXXLL motif-containing protein, functions as a general coactivator (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — UNITED STATES, 2000. — May (vol. 97, no. 11). — P. 6212—6217. — ISSN 0027-8424. — PMID 10823961.
  5. ↑ Ko, Lan; Chin William W. Nuclear receptor coactivator thyroid hormone receptor-binding protein (TRBP) interacts with and stimulates its associated DNA-dependent protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — March (vol. 278, no. 13). — P. 11471—11479. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M209723200. — PMID 12519782.
  6. ↑ 1 2 Barlev, N A; Poltoratsky V., Owen-Hughes T., Ying C., Liu L., Workman J L., Berger S L. Repression of GCN5 histone acetyltransferase activity via bromodomain-mediated binding and phosphorylation by the Ku-DNA-dependent protein kinase complex (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — UNITED STATES, 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1349—1358. — ISSN 0270-7306. — PMID 9488450.
  7. ↑ 1 2 Gell, D; Jackson S P. Mapping of protein-protein interactions within the DNA-dependent protein kinase complex (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — ENGLAND, 1999. — September (vol. 27, no. 17). — P. 3494—3502. — PMID 10446239.
  8. ↑ Yang, C R; Yeh S., Leskov K., Odegaard E., Hsu H L., Chang C., Kinsella T J., Chen D J., Boothman D A. Isolation of Ku70-binding proteins (KUBs) (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — ENGLAND, 1999. — May (vol. 27, no. 10). — P. 2165—2174. — ISSN 0305-1048. — PMID 10219089.
  9. ↑ Singleton, B K; Torres-Arzayus M I., Rottinghaus S T., Taccioli G E., Jeggo P A. The C terminus of Ku80 activates the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — UNITED STATES, 1999. — May (vol. 19, no. 5). — P. 3267—3277. — ISSN 0270-7306. — PMID 10207052.
  10. ↑ Song, K; Jung D., Jung Y., Lee S G., Lee I. Interaction of human Ku70 with TRF2 (англ.) // FEBS Lett.  (англ.) (рус. : journal. — NETHERLANDS, 2000. — September (vol. 481, no. 1). — P. 81—5. — ISSN 0014-5793. — PMID 10984620.
  11. ↑ Karmakar, Parimal; Snowden Carey M., Ramsden Dale A., Bohr Vilhelm A. Ku heterodimer binds to both ends of the Werner protein and functional interaction occurs at the Werner N-terminus (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — England, 2002. — August (vol. 30, no. 16). — P. 3583—3591. — PMID 12177300.
  12. ↑ Li, B; Comai L. Functional interaction between Ku and the werner syndrome protein in DNA end processing (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 2000. — September (vol. 275, no. 37). — P. 28349—28352. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.C000289200. — PMID 10880505.
  13. ↑ Adam, L; Bandyopadhyay D., Kumar R. Interferon-alpha signaling promotes nucleus-to-cytoplasmic redistribution of p95Vav, and formation of a multisubunit complex involving Vav, Ku80, and Tyk2 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.  (англ.) (рус. : journal. — UNITED STATES, 2000. — January (vol. 267, no. 3). — P. 692—696. — ISSN 0006-291X. — doi:10.1006/bbrc.1999.1978. — PMID 10673353.
  14. ↑ Jin, S; Kharbanda S., Mayer B., Kufe D., Weaver D T. Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — October (vol. 272, no. 40). — P. 24763—24766. — ISSN 0021-9258. — PMID 9312071.
  15. ↑ 1 2 3 Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T., Price Gerald B., Zannis-Hadjopoulos Maria. Ku antigen, an origin-specific binding protein that associates with replication proteins, is required for mammalian DNA replication (англ.) // Biochim. Biophys. Acta  (англ.) (рус. : journal. — Netherlands, 2002. — October (vol. 1578, no. 1—3). — P. 59—72. — ISSN 0006-3002. — PMID 12393188.
  16. ↑ O'Connor, Matthew S; Safari Amin, Liu Dan, Qin Jun, Songyang Zhou. The human Rap1 protein complex and modulation of telomere length (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2004. — July (vol. 279, no. 27). — P. 28585—28591. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M312913200. — PMID 15100233.
  17. ↑ Chai, Weihang; Ford Lance P., Lenertz Lisa, Wright Woodring E., Shay Jerry W. Human Ku70/80 associates physically with telomerase through interaction with hTERT (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — December (vol. 277, no. 49). — P. 47242—47247. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M208542200. — PMID 12377759.
  18. ↑ Schild-Poulter, C; Pope L., Giffin W., Kochan J C., Ngsee J K., Traykova-Andonova M., Haché R J. The binding of Ku antigen to homeodomain proteins promotes their phosphorylation by DNA-dependent protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2001. — May (vol. 276, no. 20). — P. 16848—16856. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M100768200. — PMID 11279128.
  19. ↑ Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi, Sugimoto Katsunori, Obuse Chikashi, Tsurimoto Toshiki. A proteomics approach to identify proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding proteins in human cell lysates. Identification of the human CHL12/RFCs2-5 complex as a novel PCNA-binding protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — October (vol. 277, no. 43). — P. 40362—40367. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M206194200. — PMID 12171929.
  20. ↑ Balajee, A S; Geard C R. Chromatin-bound PCNA complex formation triggered by DNA damage occurs independent of the ATM gene product in human cells (англ.) // Nucleic Acids Res.  (англ.) (рус. : journal. — England, 2001. — March (vol. 29, no. 6). — P. 1341—1351. — PMID 11239001.

Литература

  • Koike M. Dimerization, translocation and localization of Ku70 and Ku80 proteins. (англ.) // J. Radiat. Res.  (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 43, no. 3. — P. 223—236. — doi:10.1269/jrr.43.223. — PMID 12518983.
  • Chen D.J., Park M.S., Campbell E., et al. Assignment of a human DNA double-strand break repair gene (XRCC5) to chromosome 2. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1992. — Vol. 13, no. 4. — P. 1088—1094. — doi:10.1016/0888-7543(92)90023-L. — PMID 1505945.
  • Wedrychowski A., Henzel W., Huston L., et al. Identification of proteins binding to interferon-inducible transcriptional enhancers in hematopoietic cells. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1992. — Vol. 267, no. 7. — P. 4533—4540. — PMID 1537839.
  • Jeggo P.A., Hafezparast M., Thompson A.F., et al. Localization of a DNA repair gene (XRCC5) involved in double-strand-break rejoining to human chromosome 2. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1992. — Vol. 89, no. 14. — P. 6423—6427. — doi:10.1073/pnas.89.14.6423. — PMID 1631138.
  • Knuth M.W., Gunderson S.I., Thompson N.E., et al. Purification and characterization of proximal sequence element-binding protein 1, a transcription activating protein related to Ku and TREF that binds the proximal sequence element of the human U1 promoter. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1990. — Vol. 265, no. 29. — P. 17911—17920. — PMID 2211668.
  • Stuiver M.H., Coenjaerts F.E., van der Vliet P.C. The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes. (англ.) // Journal of Experimental Medicine  (англ.) (рус. : journal. — Rockefeller University Press  (англ.) (рус., 1990. — Vol. 172, no. 4. — P. 1049—1054. — doi:10.1084/jem.172.4.1049. — PMID 2212941.
  • Mimori T., Ohosone Y., Hama N., et al. Isolation and characterization of cDNA encoding the 80-kDa subunit protein of the human autoantigen Ku (p70/p80) recognized by autoantibodies from patients with scleroderma-polymyositis overlap syndrome. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1990. — Vol. 87, no. 5. — P. 1777—1781. — doi:10.1073/pnas.87.5.1777. — PMID 2308937.
  • Yaneva M., Wen J., Ayala A., Cook R. cDNA-derived amino acid sequence of the 86-kDa subunit of the Ku antigen. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1989. — Vol. 264, no. 23. — P. 13407—13411. — PMID 2760028.
  • Genersch E., Eckerskorn C., Lottspeich F., et al. Purification of the sequence-specific transcription factor CTCBF, involved in the control of human collagen IV genes: subunits with homology to Ku antigen. (англ.) // Embo J.  (англ.) (рус. : journal. — 1995. — Vol. 14, no. 4. — P. 791—800. — PMID 7882982.
  • Tuteja N., Tuteja R., Ochem A., et al. Human DNA helicase II: a novel DNA unwinding enzyme identified as the Ku autoantigen. (англ.) // Embo J.  (англ.) (рус. : journal. — 1994. — Vol. 13, no. 20. — P. 4991—5001. — PMID 7957065.
  • Le Romancer M., Reyl-Desmars F., Cherifi Y., et al. The 86-kDa subunit of autoantigen Ku is a somatostatin receptor regulating protein phosphatase-2A activity. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1994. — Vol. 269, no. 26. — P. 17464—17468. — PMID 8021251.
  • Cao Q.P., Pitt S., Leszyk J., Baril E.F. DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen. (англ.) // Biochemistry : journal. — 1994. — Vol. 33, no. 28. — P. 8548—8557. — doi:10.1021/bi00194a021. — PMID 8031790.
  • Taccioli G.E., Gottlieb T.M., Blunt T., et al. Ku80: product of the XRCC5 gene and its role in DNA repair and V(D)J recombination. (англ.) // Science : journal. — 1994. — Vol. 265, no. 5177. — P. 1442—1445. — doi:10.1126/science.8073286. — PMID 8073286.
  • Chen D.J., Marrone B.L., Nguyen T., et al. Regional assignment of a human DNA repair gene (XRCC5) to 2q35 by X-ray hybrid mapping. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1994. — Vol. 21, no. 2. — P. 423—427. — doi:10.1006/geno.1994.1287. — PMID 8088837.
  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides. (англ.) // Gene  (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Kaczmarski W., Khan S.A. Lupus autoantigen Ku protein binds HIV-1 TAR RNA in vitro. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.  (англ.) (рус. : journal. — 1993. — Vol. 196, no. 2. — P. 935—942. — doi:10.1006/bbrc.1993.2339. — PMID 8240370.
  • Blunt T., Taccioli G.E., Priestley A., et al. A YAC contig encompassing the XRCC5 (Ku80) DNA repair gene and complementation of defective cells by YAC protoplast fusion. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1996. — Vol. 30, no. 2. — P. 320—328. — doi:10.1006/geno.1995.9871. — PMID 8586433.
  • Warriar N., Pagé N., Govindan M.V. Expression of human glucocorticoid receptor gene and interaction of nuclear proteins with the transcriptional control element. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 31. — P. 18662—18671. — doi:10.1074/jbc.271.31.18662. — PMID 8702520.
  • Myung K., He D.M., Lee S.E., Hendrickson E.A. KARP-1: a novel leucine zipper protein expressed from the Ku86 autoantigen locus is implicated in the control of DNA-dependent protein kinase activity. (англ.) // Embo J.  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 16, no. 11. — P. 3172—3184. — doi:10.1093/emboj/16.11.3172. — PMID 9214634.
  • Jin S., Kharbanda S., Mayer B., et al. Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 40. — P. 24763—24766. — doi:10.1074/jbc.272.40.24763. — PMID 9312071.
Эта страница в последний раз была отредактирована 12 мая 2022 в 01:02.
Как только страница обновилась в Википедии она обновляется в Вики 2.
Обычно почти сразу, изредка в течении часа.
Основа этой страницы находится в Википедии. Текст доступен по лицензии CC BY-SA 3.0 Unported License. Нетекстовые медиаданные доступны под собственными лицензиями. Wikipedia® — зарегистрированный товарный знак организации Wikimedia Foundation, Inc. WIKI 2 является независимой компанией и не аффилирована с Фондом Викимедиа (Wikimedia Foundation).
Связаться с WIKI 2
Введение
Условия использования
Конфиденциальность