Нуклеотидная последовательность, генетическая последовательность — порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Определяется при помощи секвенирования.
Для записи нуклеотидных последовательностей ДНК по рекомендации IUPAC используются символы латинского алфавита.[1]
- A = аденин[2]
- C = цитозин
- G = гуанин
- T = тимин
- R = G A гуанин или аденин — пуриновые (purine) основания
- Y = T C пиримидиновые (pyrimidine) основания
- K = G T содержащие кето-группу
- M = A C содержащие аминогруппу
- S = G C «сильные» (strong), образующие 3 водородные связи
- W = A T «слабые» (weak), образующие 2 водородные связи
- B = G T C (любой, кроме A)
- D = G A T (любой, кроме C)
- H = A C T (любой, кроме G)
- V = G C A (любой, кроме T)
- N = A G C T (любой)
Символы, обозначающие неопределённость последовательности, необходимы, когда точная последовательность неизвестна, несущественна или известны разные её варианты.
Для записи последовательностей РНК обычно достаточно символов A, С, G, U (уридин).
Все последовательности записываются без пробелов, слева направо, от 5'-конца к 3'-концу.
Примечания
- ↑ Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences Архивная копия от 21 августа 2017 на Wayback Machine, NC-IUB, 1984.
- ↑ для удобства используются названия оснований, а не нуклеозидов
См. также
 | |
|---|---|
| В библиографических каталогах |
Эта страница в последний раз была отредактирована 9 марта 2023 в 11:10.
Как только страница обновилась в Википедии она обновляется в Вики 2.
Обычно почти сразу, изредка в течении часа.
Обычно почти сразу, изредка в течении часа.