Молекуля́рный реда́ктор — специализированная компьютерная программа, позволяющая вводить, редактировать и выводить на внешние носители информации (на бумагу, на экран) информацию о составе и структуре молекул веществ.
Для работы с химическими документами в большинстве случаев невозможно использовать только текстовые или графические редакторы общего назначения. Редактирование текстов, содержащих химическую информацию, требует использования специализированных программных инструментов.
Общий подход к созданию интерфейса химических редакторов заключается в том, что химические формулы собираются по принципу конструктора из структурных элементов (ароматические кольца, символы химической связи, стрелки и т.п.). Формула и отдельные её фрагменты могут быть модифицированы (вставка необходимых символов, изменение размера или ориентации на плоскости).
Как правило, химические редакторы снабжаются комплектами заготовок сложных формул и рисунков(шаблонов), наиболее часто употребляемых в работе (аминокислоты, пептиды, углеводы, стереоизомеры, нуклеотиды, лабораторное оборудование). Многие снабжены модулями по именованию соединений в соответствии с номенклатурой.
Химические редакторы позволяют выполнять следующие функции:
- создавать на экране химические структурные формулы, схемы реакций, лабораторные установки;
- конструировать объемные молекулярные модели и выполнять манипуляции с ними (увеличение или уменьшение моделей, вращение и перемещение их и т.д.);
- рассчитывать энергетические и пространственные параметры системы (распределение электронной плотности, энергию и длину связей, валентные углы и т.п.);
- рассчитывать энергию молекулы в стационарном и возбужденных состояниях на основе классической механической модели осциллирующих атомов;
- рассчитывать другие молекулярные характеристики и вероятность пути прохождения химических реакций.
| Программа | ОС | Лицензия |
|---|---|---|
| ChemDraw | Windows, Mac OS | Проприетарная |
| ACD/ChemSketch[1] | Windows(64-bit) | Проприетарная |
| XDrawChem[2] | Кроссплатформенный | GPL |
| BKchem[3] | Кроссплатформенный | GPL |
| JChemPaint | Кроссплатформенный | LGPL |
| Jmol | Кроссплатформенный | LGPL |
| Avogadro | GPL |
Энциклопедичный YouTube
-
1/3Просмотров:4 1459 187573
-
Avogadro. Программа 3D моделирования молекул
-
Возможности сайта Acetyl
-
Видеоурок "Создание молекулы"
Субтитры
Литература
- Наумов А.Р., Молчанова И.И. Основы эффективной работы с графическим редактором структурных химических формул ISIS/Draw. Практическое пособие - Кострома: КГУ им. Н. А. Некрасова, 2004. - 108 с. - ISBN 5-7591-0588-4
- Zhenjiang Li, Honggui Wan, Yuhu Shi, and Pingkai Ouyang. Personal Experience with Four Kinds of Chemical Structure Drawing Software: Review on ChemDraw, ChemWindow, ISIS/Draw, and ChemSketch. — ACD Publications, 2004.
Примечания
- ↑ Chemical Structure Drawing Software | ACD/ChemSketch. www.acdlabs.com. Дата обращения: 5 февраля 2021. Архивировано 11 января 2021 года.
- ↑ XDrawChem (англ.). SourceForge. Дата обращения: 5 февраля 2021. Архивировано 1 февраля 2022 года.
- ↑ BKChem. bkchem.zirael.org. Дата обращения: 5 февраля 2021. Архивировано 23 мая 2021 года.
Эта страница в последний раз была отредактирована 2 марта 2024 в 08:03.
Обычно почти сразу, изредка в течении часа.