Un tetrabucle es un motivo estructural del tipo "bucle en horquilla" formado por cuatro bases, que se presenta en la estructura secundaria del ARN, donde puede encapuchar muchas doble hélices.[2] Hay tres tipos de tetrabucles comunes en el ARN ribosomal: GRNA, UNCG y CUUG. El tetrabucle GRNA posee un par de bases guanina-adenina donde la guanina se encuentra en dirección 5' en relación con la hélice y la adenina en la dirección 3'. Los tetrabucles con la secuencia UMAC poseen esencialmente el mismo esqueleto que el tetrabucle GRNA,[3] pero puede ser menos afín a formar interacciones del tipo tetrabucle-receptor. Por lo tanto puede haber mejores elecciones para acercar extremos cuando se diseñan ARNs artificiales.
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Simulation of a GCAA tetraloop folding
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Tetraloops and pseudoknots
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2011 Wumpus Competition
Transcription
Véase también
- Estructura terciaria del ARN
Referencias
- ↑ Cate, J.H., Gooding, A.R., Podell, E., Zhou, K., Golden, B.L., Kundrot, C.E., Cech, T.R., Doudna, J.A. (1996). «Crystal structure of a group I ribozyme domain: principles of RNA packing.». Science 273 (5282): 1676-1685. PMID 8781224. doi:10.1126/science.273.5282.1678.
- ↑ Woese, C.R., Winkers, S., Gutell, R.R. (1990). «Architecture of ribosomal RNA: Constraints on the sequence of "tetra-loops"». Proc. Nati. Acad. Sci. USA 87 (21): 8467-71. PMC 54977. PMID 2236056. doi:10.1073/pnas.87.21.8467.
- ↑ Zhao, Q., Huang, H-C., Nagaswamy, U., Xia, Y., Gao, X., Fox, G.E. (2012). «UNAC tetraloops: To what extent do they mimic GNRA tetraloops?». Biopolymers 97 (8): 617-628. PMID 22605553. doi:10.1002/bip.22049.
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