Fermentibacterota o Fermentibacteria es un filo candidato de bacterias que filogenéticamente formaría parte del grupo FCB de bacterias.[1] Anteriormente se llamaban Hyd24-12. Los miembros de este filo fueron descubiertos mediante muestras metagenómicas. El filo incluye dos géneros.[2]
El análisis filogenético ha sugerido que puede ser grupo hermano de Gemmatimonadota o Latescibacteriota.[2]
Metagenómica
La secuencia del clon original utilizada para definir a Fermentibacteria como un filo (AJ535232) se recuperó del entorno de filtración fría de Hydrate Ridge (Cascadia Margin, Orlando, EE. UU.). Sin embargo los primeros genomas de este filo se recuperaron de muestras metagenómicas de digestores anaeróbicos mesófilos a gran escala en instalaciones de tratamiento de aguas residuales danesas. Se infirió que los tres genomas recuperados representan organismos que dependen de la fermentación de azúcares simples como fuente de energía, por lo que se propuso el nombre "Fermentibacteria" (derivado de la palabra "fermentar").[3][4]
Se han detectado miembros de este filo en una amplia gama de entornos, que incluyen filtraciones de metano, arenas de arrecifes de coral y boca de delfines.[5][6]
Géneros
Se han descrito los siguientes géneros:[7]
- Fermentibacter
- Sabulitectum
- Aegiribacteria
Referencias
- ↑ Genome database. Fermentibacterota.
- ↑ a b Kirkegaard, Rasmus Hansen; Dueholm, Morten Simonsen; McIlroy, Simon Jon; Nierychlo, Marta; Karst, Søren Michael; Albertsen, Mads; Nielsen, Per Halkjær (October 2016). «Genomic insights into members of the candidate phylum Hyd24-12 common in mesophilic anaerobic digesters». The ISME Journal (en inglés) 10 (10): 2352-2364. ISSN 1751-7370. PMID 27058503. doi:10.1038/ismej.2016.43.
- ↑ Knittel, Katrin; Boetius, Antje; Lemke, Andreas; Eilers, Heike; Lochte, Karin; Pfannkuche, Olaf; Linke, Peter; Amann, Rudolf (July 2003). «Activity, Distribution, and Diversity of Sulfate Reducers and Other Bacteria in Sediments above Gas Hydrate (Cascadia Margin, Oregon)». Geomicrobiology Journal 20 (4): 269-294. ISSN 0149-0451. doi:10.1080/01490450303896.
- ↑ Ruff, S. Emil; Biddle, Jennifer F.; Teske, Andreas P.; Knittel, Katrin; Boetius, Antje; Ramette, Alban (16 de marzo de 2015). «Global dispersion and local diversification of the methane seep microbiome». Proceedings of the National Academy of Sciences 112 (13): 4015-4020. ISSN 0027-8424. PMC 4386351. PMID 25775520. doi:10.1073/pnas.1421865112.
- ↑ Schöttner, Sandra; Pfitzner, Barbara; Grünke, Stefanie; Rasheed, Mohammed; Wild, Christian; Ramette, Alban (9 de mayo de 2011). «Drivers of bacterial diversity dynamics in permeable carbonate and silicate coral reef sands from the Red Sea». Environmental Microbiology 13 (7): 1815-1826. ISSN 1462-2912. PMC 3207121. PMID 21554515. doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02494.x.
- ↑ Dudek, Natasha K.; Sun, Christine L.; Burstein, David; Kantor, Rose S.; Aliaga Goltsman, Daniela S.; Bik, Elisabeth M.; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. et al. (18 de diciembre de 2017). «Novel Microbial Diversity and Functional Potential in the Marine Mammal Oral Microbiome». Current Biology: CB 27 (24): 3752-3762.e6. ISSN 1879-0445. PMID 29153320. doi:10.1016/j.cub.2017.10.040.
- ↑ Saad, Sainab; Bhatnagar, Srijak; Tegetmeyer, Halina E.; Geelhoed, Jeanine S.; Strous, Marc; Ruff, S. Emil (2017). «Transient exposure to oxygen or nitrate reveals ecophysiology of fermentative and sulfate-reducing benthic microbial populations». Environmental Microbiology (en inglés) 19 (12): 4866-4881. ISSN 1462-2920. PMC 5763382. PMID 28836729. doi:10.1111/1462-2920.13895.
Datos: Q96377874
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