| Коронавирусы | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (SARSCoV) | ||||||||
| Научная классификация | ||||||||
|
Реалм: Царство: Тип: Класс: <i>Pisoniviricetes</i> Порядок: Подпорядок: Cornidovirineae Семейство: Подсемейство: Коронавирусы |
||||||||
| Международное научное название | ||||||||
| Orthocoronavirinae | ||||||||
| Синонимы | ||||||||
|
||||||||
| Группа по Балтимору | ||||||||
| IV: (+)оцРНК-вирусы | ||||||||
| ||||||||
Коро́навирусы[2] (лат. Orthocoronavirinae) — подсемейство вирусов из семейства Coronaviridae[3], объединяющее оболочечные РНК-содержащие плеоморфные[К 1] вирусы, вызывающие широкий спектр заболеваний различной тяжести у животных, включая человека[4]. В большинстве случаев коронавирусные инфекции протекают в лёгкой форме, однако в XXI веке происходили вспышки тяжёлых заболеваний, вызываемых бетакоронавирусами MERS-CoV и SARS-CoV[4], а также SARS-CoV-2. Это вирусы с (+)одноцепочечной РНК-геном и нуклеокапсидом спиральной симметрии. Размер генома коронавирусов варьируется от приблизительно 27 до 34 килобаз, самый большой среди известных РНК-вирусов.
Геном
Коронавирусы содержат геном с одноцепочечной смысловой РНК. Размер их генома колеблется от 27 до 34 килобаз является одним из самых больших среди РНК-вирусов. Геном имеет 5'-метилированный кэп и 3'-полиаденилированный хвост. Геномная организация коронавируса: 5'-НТО лидерная последовательность — репликаза / транскриптаза — шип (S) — оболочка (E) — нуклеокапсид (N) — 3’НТО — поли(A) хвост. Открытые рамки считывания 1a и 1b, которые занимают первые две трети генома, кодируют полипротеин репликазы / транскриптазы. Полипротеины репликазы / транскриптазы саморасщепляется, образуя неструктурные белки (nsps). Далее идут рамки считывания, кодирующие четыре основных структурных белка: шип, оболочку, мембрану и нуклеокапсид. Перемежаясь с этими рамками расположены рамки считывания для вспомогательных белков. Количество вспомогательных белков и их функция различны для разных коронавирусов.
Жизненный цикл
Зарождение
Инфекция начинается, когда вирусный шип (S) гликопротеин прикрепляется к своему комплементарному рецептору клетки-хозяина. После прикрепления протеаза клетки-хозяина расщепляется и активирует прикрепленный к рецептору спайковый белок. В зависимости от доступной протеазы клетки-хозяина, расщепление и активация позволяют клетке проникать посредством эндоцитоза или прямого слияния вирусной оболочки с мембраной хозяина. При проникновении в клетку-хозяина вирусная частица не имеет покрытия и ее геном попадает в цитоплазму клетки. Геном РНК коронавируса имеет 5'-метилированную кепку и 3'-полиаденилированный хвост, что позволяет РНК прикрепляться к рибосоме клетки-хозяина для трансляции. Рибосома хозяина транслирует исходную перекрывающуюся открытую рамку считывания генома вируса и образует длинный полипротеин. Полипротеин имеет свои собственные протеазы, которые расщепляют полипротеин на множество неструктурных белков.
Классификация
До 2009 года представителей подсемейства объединяли в род Coronavirus[5], но в 2009 году систематику коронавирусов пересмотрели: Coronavirus разделили на 3 рода (Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus), объединённых в подсемейство Coronavirinae[6].
Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) по состоянию на апрель 2020 года выделяет в подсемействе 4 рода[7]:
- Род Alphacoronavirus (14 подродов и 19 видов)
- Род Betacoronavirus (5 подродов и 14 видов)
- Род Gammacoronavirus (3 подрода и 5 видов)
- Род Deltacoronavirus (3 подрода и 7 видов)
Примечания
- Комментарии
- ↑ Плеоморфные вирусы — вирусы, варьирующие по форме и размерам.
- Источники
- ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
- ↑ Коронавирусы / Горбаленя А. Е. // Конго — Крещение. — М. : Большая российская энциклопедия, 2010. — С. 352. — (Большая российская энциклопедия : [в 35 т.] / гл. ред. Ю. С. Осипов ; 2004—2017, т. 15). — ISBN 978-5-85270-346-0.
- ↑ Щелканов М. Ю., Попова А. Ю., Дедков В. Г., Акимкин В. Г., Малеев В. В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) // Инфекция и иммунитет : научная статья. — 2020. — Т. 10, № 2. — С. 221—246. Архивировано 25 июня 2020 года.
- ↑ 1 2 Zumla A., Chan J. F. W., Azhar E. I., Hui D. S. C., Yuen K.-Y. Coronaviruses — drug discovery and therapeutic options (англ.) // Nature Reviews Drug Discovery. — 2016. — Vol. 15. — P. 327—347. — doi:10.1038/nrd.2015.37.
- ↑ ICTV Taxonomy History for Coronavirus Архивная копия от 9 августа 2016 на Wayback Machine на сайте ICTV (англ.) (Дата обращения: 19 июля 2019).
- ↑ Revision of the family Coronaviridae : [англ.] : [арх. 7 февраля 2019] // ICTV. — Code(s) assigned: 2008.085-126V. — 2008. — P. 3—6. — 37 p.
- ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Дата обращения: 25 мая 2020).
Ссылки
Эта страница в последний раз была отредактирована 25 января 2024 в 16:03.
Обычно почти сразу, изредка в течении часа.